深圳市光明科学城发展建设有限公司（以下简称：光明科学城公司）股权比例为：深业集团(代表市国资委，占股60%)、市引导基金(代表市财政局，占股30%)、光明科发集团(代表光明区政府，占股10%)，注册资本100亿元。 管理光明科学城规划总用地面积99平方公里，含核心区5平方公里，大装置集聚区12.7平方公里，以及外围产业转化区、光明中心区等。
光明科学城公司作为光明科学城重大科技基础设施“投、建、运、转”一体化的综合统筹平台，管理运行机制走出一条“政府主导、平台统筹、市场化运作”的新型举国体制深圳之路。旨在依托世界级重大科技基础设施集群和前沿科学交叉研究平台，以信息、生命、新材料领域关键共性技术、前沿引领技术、现代工程技术、颠覆性技术创新为主攻方向，协同推进科技创新、产业创新、体制机制创新、运营模式创新和协同开放创新，汇聚国际一流创新资源，培育内生增长的原创型产业。