南京金陵司法鉴定所于2006年8月由江苏省司法厅批准成立，涉及法医临床鉴定、法医病理鉴定、文书鉴定、痕迹鉴定四个领域，并于2009年率先通过检查机构能力认证认可（CNAS），2010年通过国家级资质认定。与南京大学现代分析中心构建成立“法庭科学技术研究平台” ；与司法部司法鉴定研究所合作技术共享平台；与专业汽车检测站成立车辆痕迹鉴定技术检测点；与南京多家医院合作，使现代化的医疗仪器和医疗专家为本所法医鉴定提供质量保证。