中国水产科学研究院黄海水产研究所系农业部所属综合性海洋水产研究机构。1947年1月始建于上海，1949年9月迁至青岛。

现有在职职工348人中，其中有中国工程院院士3人，高级专业技术人员119人。有3人被授予国家级有突出贡献专家，5人入选国家百千万人才工程第一、二层次人选（新世纪百千万人才工程国家级人选），12人次分别获得过“光华工程科技奖”、“何梁何利基金科学与技术进步（创新）奖”、“中华农业英才奖”、“全国优秀科技工作者”、“全国农业科技先进工作者”、“中华农业科教奖”、“青岛市科学技术功勋奖”、“青岛市突出贡献人才奖”；2人入选青岛市科技将才专项计划，58人享受政府特殊津贴，14人被评为部级有突出贡献中青年专家，7人获省级专业技术拔尖人才（有突出贡献中青年专家）称号，12人次获青岛市专业技术拔尖人才称号。2006、2007年被山东省科技厅批准设置“水产种质资源与生物技术”和“海洋渔业资源与生态”泰山学者岗位；2人获泰山学者特聘教授；现有博士生、硕士生导师58人，客座研究员和访问学者36人。2003年被国家人事部批准设立博士后科技工作站，进站博士后24人。现有在读博士27人，硕士198人。

所内设海洋可捕资源与生态系、海水养殖生态与容纳量、海水养殖生物疾病控制与分子病理学、种质资源与工程育种、海洋产物资源与酶工程、海洋渔业环境与生物修复6个实验室，水产品安全与质量检测、海水鱼类养殖与设施渔业、食品工程与营养3个研究室；4个实验基地、4个挂靠机构；拥有世界先进水平的“北斗”号海洋科学调查船；编辑出版学报级中文核心期刊《渔业科学进展》（双月刊）。

主要研究领域为海洋生物资源可持续开发与利用，包括海水增养殖、渔业资源与环境和渔业工程技术等。先后完成近1000项科研课题，近200项科研成果获奖，先后获得320余项不同层次的奖励。其中，获国家科技进步一等奖2项，其他国家级奖励30项。承担的科学研究项目有：国家专项、国家重大基础研究项目，如《国家重点基础研究发展规划》（973）项目，《国家自然科学基金》项目、《国家高科技研究发展计划》（863）项目、国家科技攻关、省市科技项目以及成果产业化项目等。

国际合作与交流日益发展。先后与136个国家、地区、国际组织及单位开展科技合作、技术交流、资料交换和人才培养等项合作。

1994年组建资源环境研究中心、海水养殖研究中心和海洋渔业工程技术开发中心；1995年被国家科委确认为“改革与发展重点研究所”；1996年被农业部评为“基础研究十强”；1997～1998、1999～2000、2001～2002年度连续三次被中国水产科学研究院评为“文明单位”；1999年被科技部确立为科技体制改革试点单位；2002年开始非营利科研机构改革。

建成“适应新经济体制的、现代化的、国家级的海洋渔业科技创新中心”为本所奋斗目标！“建设创新型研究所”是黄海所新的追求和目标。