江西南华医药有限公司前身――江西南昌医药（集团）有限责任公司由原江西省内两家最大的医药商业企业“江西省医药公司”和“南昌市医药公司”通过资产重组，于1998年2月组建而成。
以改革为契机，实施向外扩张的发展战略。2001年12月31日是由江西省医药集团公司和上海市医药股份有限公司强强合作，在江西省人民政府、上海市人民政府的关心支持下，注册成立江西南华医药有限公司。公司注册资本1.8亿元，公司主要经营范围有化学原料药、化学药制剂、抗生素、生化药品、生物制品、诊断药品、中药材、中成药、中药饮片、医疗器械、化学试剂、玻璃仪器、营养保健品、化妆品等大类。经营方式主要从事医药商品的批发业务和零售连锁经营。